בדיקת ה-MEG אינה פולשנית ואינה כואבת.
במהלך הבדיקה, תתבקש לשכב (ללא תנועה ככל הניתן) במיטה. ראשך יונח בתוך משענת המיועדת לו, ומעליו תמצא קסדת ה-MEG.
ברישום גלי המוח באמצעות ה-MEG אין קרינה אלקטרומגנטית ולא נשמעים צפצופים.
במהלך הבדיקה ניתן לנמנם ולישון. לעיתים, תורשה לצפות בסרט (אילם) – במידה ואינו מהווה הפרעה לבדיקה.
בסיום הבדיקה יסייעו בידך הצוות המטפל והמלווה האישי לקום.
מייד עם סיום הבדיקה, ובהנחה כי אין צורך בטיפול רפואי, תשוחרר לביתך.